胃手术切除了幽门或迷走神经干切断使幽门失去神经支配，十二指肠内容物返流入胃的机会明显增多。其中的胆酸可溶解脂蛋白而破坏胃粘膜的屏障作用，H+即进入胃腔，而H+则由胃腔进入胃粘膜。进入胃粘膜内的H+又可刺激肥大细胞释放组胺。后者再刺激胃酸和胃蛋白酶的分泌，进而加重胃粘膜的损伤，并产生炎症、糜烂和溃疡。十二指肠液中的胰液与胆酸对胃粘膜的损伤更有协同作用。此外，胃手术尤其是毕氏Ⅱ式手术后，对胃粘膜屏障有加强作用、能抵抗H+逆向弥散作用的胃泌素分泌减少，使胃粘膜的屏障机能削弱，也是反流性胃炎发病的因素之一。
具体地说，导致胆汁返流性胃炎的原因有：
(1)胃大部切除术后，幽门括约肌被切除，失去防止胆汁返流的结构。
(2)幽门括约肌功能失调，幽门呈开放状态，十二指肠更畅通无阻，胆汁返流入胃，这种状态的病人较多。或因幽门螺旋杆菌感染，致使幽门炎症、水肿、感染，幽门括约肌功能失调。
(3)胆囊结石、长期吸烟、饮酒、高脂肪饮食等也会引起胆汁返流。
